Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNS3Q68CZ2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms