Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG9BQ674R7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms