Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms