Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms