Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GARNL3Q5VVW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms