Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms