Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf53Q5VUE5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms