Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
MYOM3Q5VTT5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MYOM3Q5VTT5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MYOM3Q5VTT5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MYOM3Q5VTT5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MYOM3Q5VTT5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MYOM3Q5VTT5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MYOM3Q5VTT5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
MYOM3Q5VTT5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms