Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXDC1Q5TGL8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms