Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms