Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms