Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC122Q5T0U0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms