Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFHC1Q5JVL4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms