Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR44Q5JSH3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms