Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR4Q5GH76 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR4Q5GH76 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.1 ms