Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD39Q53RE8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms