Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GLE1Q53GS7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GLE1Q53GS7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms