Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACSM3Q53FZ2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACSM3Q53FZ2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms