Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms