Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms