Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms