Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms