Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP100Q494V2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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