Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT71Q3SY84 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms