Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms