Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM1Q2NKQ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms