Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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PTPRNQ16849 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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PTPRNQ16849 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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PTPRNQ16849 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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PTPRNQ16849 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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