Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP6Q16828 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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