Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PRR4Q16378 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PRR4Q16378 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PRR4Q16378 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PRR4Q16378 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PRR4Q16378 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PRR4Q16378 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PRR4Q16378 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PRR4Q16378 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PRR4Q16378 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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