Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK3Q16288 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms