Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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