Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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