Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH1Q15438 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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