Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF4Q15306 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms