Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN1Q14457 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN1Q14457 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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