Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG2Q14126 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms