Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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