Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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