Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms