Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P11Q13670 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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