Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDAP1Q13442 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDAP1Q13442 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms