Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE3BQ13370 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3BQ13370 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3BQ13370 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
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