Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF1Q13351 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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