Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME3Q13232 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME3Q13232 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NME3Q13232 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME3Q13232 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME3Q13232 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME3Q13232 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME3Q13232 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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