Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.688e-7■■■■□ 26.1
TARDBPQ13148 PLCL1-202ENST00000435320 6665 ntTSL 218.01■□□□□ 0.478e-7■■■■□ 26.1
TARDBPQ13148 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.768e-11■■■■□ 26.1
TARDBPQ13148 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.398e-11■■■■□ 26.1
TARDBPQ13148 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.838e-11■■■■□ 26.1
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TARDBPQ13148 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.558e-11■■■■□ 26.1
TARDBPQ13148 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 26.1
TARDBPQ13148 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 26.1
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TARDBPQ13148 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 26.1
TARDBPQ13148 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 26.1
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TARDBPQ13148 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.08□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 26.1
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TARDBPQ13148 TCERG1-201ENST00000296702 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.725e-7■■■■□ 26
TARDBPQ13148 TCERG1-216ENST00000549332 3518 ntTSL 510.2□□□□□ -0.785e-7■■■■□ 26
TARDBPQ13148 TCERG1-205ENST00000505285 486 ntTSL 26.7□□□□□ -1.345e-7■■■■□ 26
TARDBPQ13148 TCERG1-206ENST00000506524 3787 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.495e-7■■■■□ 26
TARDBPQ13148 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 56.34□□□□□ -1.397e-10■■■■□ 26
TARDBPQ13148 PTH2R-202ENST00000419079 811 ntTSL 26.39□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 26
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TARDBPQ13148 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 26
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TARDBPQ13148 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 217.61■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST3GAL3-223ENST00000479383 873 ntTSL 317.11■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 26
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TARDBPQ13148 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 26
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TARDBPQ13148 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 26
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TARDBPQ13148 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.782e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.762e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.762e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.122e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 57.47□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST7-216ENST00000443979 805 ntTSL 57.24□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST7-209ENST00000417919 577 ntTSL 45.11□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST7-OT4-205ENST00000471110 591 ntTSL 44.82□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 26
TARDBPQ13148 ST7-211ENST00000421345 531 ntTSL 44.31□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 26
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TARDBPQ13148 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 26
TARDBPQ13148 AC104806.2-201ENST00000502400 1991 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.044e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.613e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.012e-9■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.994e-10■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.844e-10■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.029e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.159e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-10■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.184e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 LINC00470-203ENST00000577867 1211 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.614e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 LINC00470-204ENST00000578835 674 ntTSL 28.09□□□□□ -1.114e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 LINC00470-206ENST00000581212 721 ntTSL 1 (best)5.61□□□□□ -1.514e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 LINC00470-209ENST00000582862 424 ntTSL 1 (best)5.61□□□□□ -1.514e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)3.61□□□□□ -1.834e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.271e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 NEK7-205ENST00000442588 519 ntTSL 515.84■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.336e-7■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 25.9
TARDBPQ13148 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 25.9
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