Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms