Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 ATG26YLR189C 3597 nt3.33□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 FUS2YMR232W 2034 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 REC8YPR007C 2043 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 CIN1YOR349W 3045 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 SLD5YDR489W 885 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YJR020WYJR020W 333 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 RPL17AYKL180W 555 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 GOT1YMR292W 417 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YNR025CYNR025C 360 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 BRX1YOL077C 876 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YOR152CYOR152C 771 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 LTP1YPR073C 486 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YCL007CYCL007C 393 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YNL011CYNL011C 1335 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 CDC40YDR364C 1368 nt3.32□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 VAC14YLR386W 2643 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 POL4YCR014C 1749 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 AVT5YBL089W 1380 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 RAV2YDR202C 1056 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 VAB2YEL005C 849 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YIL141WYIL141W 390 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 CAP1YKL007W 807 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YKL069WYKL069W 543 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YPT52YKR014C 705 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 VAM10YOR068C 345 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 snR35snR35 204 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 PMT6YGR199W 2280 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 GLC3YEL011W 2115 nt3.31□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 ANR2YKL047W 1551 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 XRN1YGL173C 4587 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YCL020WYCL020W 1317 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 REG1YDR028C 3045 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YGR073CYGR073C 372 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 GCY1YOR120W 939 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 snR24snR24 89 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 MSH2YOL090W 2895 nt3.3□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 TGL3YMR313C 1929 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 MGT1YDL200C 567 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 LIF1YGL090W 1266 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YGR126WYGR126W 693 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YHR180WYHR180W 492 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YHR212CYHR212C 336 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YAR060CYAR060C 336 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YBR053CYBR053C 1077 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 RPC40YPR110C 1008 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 RRP15YPR143W 753 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 HFM1YGL251C 3564 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 CSR2YPR030W 3366 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YTA7YGR270W 4140 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 DRS2YAL026C 4068 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 MSR1YHR091C 1932 nt3.29□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 VBA4YDR119W 2307 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 NUR1YDL089W 1455 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 MSH4YFL003C 2637 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 MYO3YKL129C 3819 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 MYO5YMR109W 3660 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 NSE4YDL105W 1209 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 USE1YGL098W 738 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YGL214WYGL214W 486 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 THG1YGR024C 714 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YAR070CYAR070C 300 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YNL013CYNL013C 378 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 YBR063CYBR063C 1215 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 REF2YDR195W 1602 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 DNM1YLL001W 2274 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 CWH41YGL027C 2502 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 PEX5YDR244W 1839 nt3.28□□□□□ -1.88
SPE4Q12455 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 KRE2YDR483W 1329 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 GYL1YMR192W 2163 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 YCR013CYCR013C 648 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 KEI1YDR367W 666 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 YFL015CYFL015C 495 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 AIM18YHR198C 966 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 VMA5YKL080W 1179 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 SDS22YKL193C 1017 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 RPL15AYLR029C 615 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 ATG38YLR211C 681 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 PRM6YML047C 1059 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 YNL089CYNL089C 477 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 RHO5YNL180C 996 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 MPD2YOL088C 834 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 SCD6YPR129W 1050 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 SHG1YBR258C 429 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 SHQ1YIL104C 1524 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 FRE8YLR047C 2061 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 EXO5YBR163W 1758 nt3.27□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 MUS81YDR386W 1899 nt3.26□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 YKL075CYKL075C 1353 nt3.26□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 PCI8YIL071C 1335 nt3.26□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 YDR133CYDR133C 336 nt3.26□□□□□ -1.89
SPE4Q12455 ECO1YFR027W 846 nt3.26□□□□□ -1.89
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