Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 DNM1YLL001W 2274 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 AVT2YEL064C 1443 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 STN1YDR082W 1485 nt2.99□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MDM10YAL010C 1482 nt2.99□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YEL010WYEL010W 351 nt2.99□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.99□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 TFB6YOR352W 1032 nt2.99□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 CMK1YFR014C 1341 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 ERG20YJL167W 1059 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 SRL3YKR091W 741 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 GCY1YOR120W 939 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MRS2YOR334W 1413 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MET10YFR030W 3108 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 VAC14YLR386W 2643 nt2.98□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 TCD1YHR003C 1290 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 DOG2YHR043C 741 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 COX23YHR116W 456 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YHR212CYHR212C 336 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YKL070WYKL070W 510 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 SED5YLR026C 1023 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YAR060CYAR060C 336 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YNL276CYNL276C 396 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 IKI3YLR384C 4050 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YNR063WYNR063W 1824 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YDR239CYDR239C 2364 nt2.97□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 NET1YJL076W 3570 nt2.96□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 SWC4YGR002C 1431 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 SEN54YPL083C 1404 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 CDC123YLR215C 1083 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 THI80YOR143C 960 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 POM152YMR129W 4014 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 NSA1YGL111W 1392 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 HOP1YIL072W 1818 nt2.96□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YIL169CYIL169C 2988 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 UBP15YMR304W 3693 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 BOI1YBL085W 2943 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 PFF1YBR074W 2931 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 RPS14AYCR031C 414 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 NRG1YDR043C 696 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 CPR5YDR304C 678 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 GIC2YDR309C 1152 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 EMI1YDR512C 564 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 LSM4YER112W 564 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 SEC4YFL005W 648 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 COG7YGL005C 840 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 VMA10YHR039C-A 345 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 MCR1YKL150W 909 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 ADI1YMR009W 540 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 IMP4YNL075W 873 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 MER1YNL210W 813 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 AIM4YBR194W 372 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YOL057WYOL057W 2136 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YNL193WYNL193W 1677 nt2.95□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 SAD1YFR005C 1347 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YMR046CYMR046C 1323 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 GCD6YDR211W 2139 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 HYP2YEL034W 474 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 VEL1YGL258W 621 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YKL131WYKL131W 522 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YBL055CYBL055C 1257 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 NIP7YPL211W 546 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 snR35snR35 204 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 snR44snR44 211 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 HFD1YMR110C 1599 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 VPS30YPL120W 1674 nt2.94□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 TRM82YDR165W 1335 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 SSN2YDR443C 4263 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 TFB1YDR311W 1929 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 ERP3YDL018C 678 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 DSE2YHR143W 978 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 BAT1YHR208W 1182 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YJL114WYJL114W 681 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 MPP6YNR024W 561 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 UFE1YOR075W 1041 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 TYE7YOR344C 876 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YPL142CYPL142C 318 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 ESC1YMR219W 4977 nt2.93□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 ERG11YHR007C 1593 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YHR080CYHR080C 4038 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 TVP15YDR100W 432 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 FIN1YDR130C 876 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 HPA3YEL066W 540 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YGL117WYGL117W 798 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 RSR1YGR152C 819 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 YIL054WYIL054W 318 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 SYS1YJL004C 612 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 RRD2YPL152W 1077 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 RRG8YPR116W 834 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 NOP56YLR197W 1515 nt2.92□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 FLO5YHR211W 3228 nt2.91□□□□□ -1.94
NFI1Q12216 BSC1YDL037C 987 nt2.91□□□□□ -1.94
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