Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YML037CYML037C 1023 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YBL096CYBL096C 309 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 THI80YOR143C 960 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YOR331CYOR331C 558 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 ACM1YPL267W 630 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 SPP381YBR152W 876 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 ESL1YIL151C 3357 nt2.35□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YJR061WYJR061W 2808 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 MAK5YBR142W 2322 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 CDC20YGL116W 1833 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YDR290WYDR290W 330 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YGL218WYGL218W 651 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YGR114CYGR114C 390 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YLR365WYLR365W 333 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.34□□□□□ -2.03
USB1Q12208 NFT1YKR103W 3657 nt2.34□□□□□ -2.04
USB1Q12208 CLN2YPL256C 1638 nt2.34□□□□□ -2.04
USB1Q12208 VPS9YML097C 1356 nt2.34□□□□□ -2.04
USB1Q12208 NUF2YOL069W 1356 nt2.34□□□□□ -2.04
USB1Q12208 PSD2YGR170W 3417 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 TOP2YNL088W 4287 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 MRPL9YGR220C 810 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YIL024CYIL024C 570 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YLR311CYLR311C 348 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 SRB8YCR081W 4284 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 MSH4YFL003C 2637 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 SSN2YDR443C 4263 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YKU80YMR106C 1890 nt2.33□□□□□ -2.04
USB1Q12208 VHR1YIL056W 1923 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 SEC26YDR238C 2922 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 ISW1YBR245C 3390 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 AXL1YPR122W 3627 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 SLP1YOR154W 1764 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RRG1YDR065W 1098 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YDR222WYDR222W 1248 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 HYP2YEL034W 474 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RPL14BYHL001W 417 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 PCL7YIL050W 858 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 MRPL27YBR282W 441 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YNL011CYNL011C 1335 nt2.32□□□□□ -2.04
USB1Q12208 PSP1YDR505C 2526 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 DUG2YBR281C 2637 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YPL150WYPL150W 2706 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 FRE8YLR047C 2061 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YDL026WYDL026W 312 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 ISC10YER180C 804 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 KEG1YFR042W 603 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YLL047WYLL047W 384 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YAR069CYAR069C 294 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 JIP3YLR331C 378 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YLR339CYLR339C 552 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 EAF7YNL136W 1278 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 LCL1YPL056C 306 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 SMY2YBR172C 2223 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 HBT1YDL223C 3141 nt2.31□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RIM13YMR154C 2184 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RTT10YPL183C 3042 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YGL159WYGL159W 1113 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YGR018CYGR018C 330 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 BAT1YHR208W 1182 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RPS22AYJL190C 393 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 PSY3YLR376C 729 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RUF20RUF20 443 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 IRC14YOR135C 342 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RPS10AYOR293W 318 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RRP14YKL082C 1305 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 VAC8YEL013W 1737 nt2.3□□□□□ -2.04
USB1Q12208 IRA2YOL081W 9240 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 BOI1YBL085W 2943 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 NAB3YPL190C 2409 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 ENP2YGR145W 2124 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 SGM1YJR134C 2124 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 WHI3YNL197C 1986 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 ORC2YBR060C 1863 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 AVT2YEL064C 1443 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 ARI1YGL157W 1044 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 BRR6YGL247W 594 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 PRE8YML092C 753 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 TRM112YNR046W 408 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 ATG29YPL166W 642 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 GRX1YCL035C 333 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 ESL2YKR096W 3588 nt2.29□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RLI1YDR091C 1827 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 VPS64YDR200C 1815 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 FKS3YMR306W 5358 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 PFF1YBR074W 2931 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 GIN4YDR507C 3429 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 snR70snR70 164 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 ECM11YDR446W 909 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YKL162CYKL162C 1209 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 CDC123YLR215C 1083 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.28□□□□□ -2.04
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