Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms